Las ideas de Seguridad Social se generaron con atención a la población en problemas de salud comunitaria. En 1936 se fundó el Dispensario No.2, el mismo que se independizó en 1938 consiguiendo hacer hospitalización de los afiliados en el Hospital “San Vicente de Paúl” hasta 1954 que se inicia la atención en la Clínica del Seguro Social en Cuenca ubicada en el centro de la ciudad, en la calle Bolívar.

Tenía personal de salud de la mejor capacidad, sin embargo, las exigencias crecían a tal punto que ya no daba abasto el local en que funcionaban dichos servicios por lo que se ejecutó la exigencia de un nuevo local. El 1 de agosto de 1957 se pudo adquirir un terreno de lo que posteriormente el 3 de noviembre de 1969 funcionaría como el Hospital Regional, con capacidad de 150 camas; desde esa fecha empezó prestando sus servicios a sus afiliados en sus diversas necesidades ya sea en consulta externa, hospitalización, cuidados intensivos, hemodiálisis, etc.

Años más tarde el número de afiliados aumentó abruptamente incluyendo el Seguro Campesino y la Afiliación Voluntaria, la atención al hijo de la afiliada hasta el primer año de vida; frente a esto la infraestructura fue mínima y no cubría las necesidades de los afiliados en cuanto a hospitalización, por lo que el Consejo Superior, máximo organismo del IESS, en sesión del 30 de julio de 1990, autorizó al Comité de Contratación del Instituto Ecuatoriano de Seguridad Social que convoque a licitación, para la construcción del Hospital del IESS en la Ciudad de Cuenca, para la regional 3 que comprende Azuay, Cañar y Morona Santiago, en sus terrenos ubicados en el sector de Monay, de 40.000 m2 comprendido entre las calles Av. Rayoloma, Cuzco, Popayán y José Carrasco Andrade, al sureste de la ciudad de Cuenca, con una capacidad de 317 camas, con estructura de hormigón armado, tabiquería, de ladrillo, ventanas de aluminio y vidrio, pisos de vinil y baldosa; cielos rasos de fibra mineral y malla enlucida.

La construcción del nuevo Hospital se inició el 10 de julio de 1991 y se terminó la obra física el 28 de mayo de 1998. Fue bautizado con el nombre del Doctor José Carrasco Arteaga. Se inauguró el 3 de noviembre del 2000.

El Hospital José Carrasco Arteaga, es provincial y docente; presta sus servicios a las provincias de Azuay, Cañar, Morona Santiago, Loja, El Oro (zona alta) y Zamora Chinchipe.

Labora en forma ininterrumpida durante los 365 días de año. La Consulta Externa funciona doce horas consecutivas (07:00 a 19:00 H.). Durante los fines de semana y feriados, el Servicio de Urgencias, Hospitalización y Cirugías de emergencia, laboran en forma permanente. Es un hospital de Nivel III, que quiere decir especializado.